新医药产业是连云港经济技术开发区的传统优势产业，目前全区税收收入的三分之一来自该产业。国家级新医药产业基地自2001年底经科技部批建以来，经过近几年的发展，新型抗肿瘤药、新型肝病药物、麻醉镇痛药物、新型中成药、新型药用包装材料、医用消毒灭菌设备等六大产品群优势日益凸现，有国家级一类新药6个，二类新药29个，三类新药8个，四类新药47个。已经成为连云港经济技术开发区高新技术产业发展的重要载体和区域经济增长点。2004年被江苏省认定为省高新技术特色产业示范基地，是苏北地区唯一一家获批的示范基地，2007年被列入江苏省重点培育产业集群。目前，基地中现有骨干企业6家，工业总产值、销售收入、利税增长率已连续5年保持在35%以上。

     主导产品有抗肿瘤药、麻醉镇痛药，以及桂枝茯苓胶囊等妇科药、抗骨质增生胶囊等骨伤科药，另外还有内分泌药、抗生素药、心血管药、金振口服液等儿科药、消化道类药、精神类药物，和各类消毒灭菌设备、消毒清洗设备等。

    2、江苏康缘药业股份有限公司 国家重点高新技术企业，拥有国家级博士后科研工作站，列全国中药行业20强、全国制药工业企业百强，创新能力排全国中药工业企业前三名、制药工业企业前二十名，其发展目标是建成中国中药现代化示范企业。

    3、江苏豪森药业股份有限公司 国家重点高新技术企业，拥有国家级博士后科研工作站，主要从事抗生素类、抗肿瘤类、消化道类、内分泌类及精神类等五大类药品的研发、生产和销售。2004年进入全国医药企业五十强，福布斯2006中国潜力100列第七位。

    4、连云港千樱医疗设备有限公司 国内知名的清洗、灭菌设备专业制造商，年产各类消毒灭菌设备、消毒清洗设备3800台套，其中自行研制的FWMG系列防污灭菌器，打破了此类设备依赖进口的状况。

    5、江苏中金玛泰医药包装有限公司 国内最早开发、生产药用包装材料的专业公司，目前为国内最大的医用包装材料生产商。SP易撕膜、纸铝塑复合膜、复合成型材料、PP/PP/PP三层共挤输液用膜等药用包装材料，以及拓展研制的LP电池膜，均为填补国内空白产品。

    2、恒瑞药业生产基地 总投资3亿元，主要从事原料药医药中间体开发和研制，项目硬件均按美国FDA要求设计。

    3、恒瑞研发中心 总投资4.6亿元，主要由化学合成和制剂研究两部分组成，按照国际标准进行设计，项目建成后，可成为省内一流的药品研究基地和集工艺研究、制剂研究、新药报批等多功能为一体的综合性科研机构，达到开发国家级各类新药的技术水平。

    4、江苏苏云医疗器材有限公司新型医疗器材项目 总投资1.5亿元，主要生产拥有国家十五项发明专利，包含新型一次性输注器具、新型医用妇科器具和新型微电脑康复治疗系统等三个大类的新型医疗器械。

    5、连云港贵科药业有限公司新型原料药技改项目 总投资5600万元的新型原料药（克拉曲滨）技改项目，计划2008年9月份试生产。

    6、康缘工业园项目 总投资约8亿元，是集生产、研发、培训于一体的现代化生态型工业园区。项目共分两期建设，总投资3亿元的一期注射剂工厂2009年建成投产；二期中药原料车间、OEM（代加工）车间、科研行政中心等，计划于2010年前建成。项目全部达产后，年可实现销售收入约30亿元。

    国家级新医药产业基地建设以来，连云港市政府、开发区管委会在扶持自主创新方面出台了多项政策措施，包括科学规划和建设软硬件环境，吸引高端人才，建设研发和招商平台，培植骨干企业等。另外，将有限的资源向骨干企业倾斜，通过成立科技扶持风险基金和所得税返还等政策扶植自主创新，特别出台了“一厂一策”的政策。按照5亿元、10亿元两个档次，对税收贡献超过全市平均数以上的企业，每年返还其超过税收部分的一半，用于骨干企业的自主创新和市场开发。

     科技主管部门在支持基地发展方面采取了“政府引导、政策扶持、资源整合、骨干培育、产业聚集”的做法，即通过政府引导，增强企业的自主创新和产业化能力，形成医药产业升级的技术优势；通过政策扶持，增强企业的后续发展能力，形成了医药产业聚合的载体优势；通过资源整合，增强企业加快发展的内在动力，形成医药产业竞争的机制优势；通过骨干培育，发展一批具有自主知识产权和核心竞争力、具有较强带动力和辐射力的医药大企业集团，形成医药产业扩张的比较优势；通过产业集聚，提升高度专业化分工基础上的产业配套条件，形成医药产业发展的综合优势。

   按照 “产学研一体化发展”的原则，以优化产业结构和培育特色优势为目标，加大具有自主知识产权新产品和新技术的开发，着力打造以企业为主体的创新平台，推动新医药产业基地实现优势产业高度集聚、科技资源优化配置、科技经济一体化发展，构建以化学合成药、海洋医药、现代中药及制剂为主体，以医疗设备和器材、药品包装材料等上下游产品为辅翼的产业结构模式，强化关联产业的协同发展能力，进一步凸显新型抗肿瘤药物、新型肝病药物、抗高血压药物、消化道药物、现代中药及制剂、药用复合包装材料、医疗灭菌设备等领域的技术优势和产业优势。力争至2010年，新医药产业基地新增省级工程技术研究中心4家，省级工程技术研究中心达到10家，确保新医药产业基地的年均研发（R＆D）投入占新医药产业基地总销售收入的6％以上。努力把新医药产业基地建成省内著名、国内知名的现代化医药产业集聚区。